Nació en Santiago de Chile, pero hasta los 13 años vivió en Encino, California.  Estudió Periodismo en la Universidad de Chile. Ha publicado tres novelas Mala Onda, Por favor, rebobinar, Tinta roja y el libro de cuentos Sobredosis. También ha co-editado dos antologías internacionales McOndo y Se habla Español, y una nacional, Cuentos con walkman.

Escribió y produjo el filme Dos hermanos (en un lugar de la noche). Sus libros más recientes son Primera parte  (una recopilación de sus trabajos periodísticos) y Dos hermanos: tras la ruta de En un lugar de la noche. Tinta roja fue adaptada al cine por el cineasta peruano Francisco Lombardi.

En 1999, la revista Time y CNN lo eligieron como uno de los 50 líderes latinoamericanos del nuevo milenio. Colabora con medios periodísticos tanto chilenos como norteamericanos.

En el cine debuta como director con Se arrienda (2005). Protagonizada por Luciano Cruz Coke, Francisca Lewin, Ignacia Allamand y Felipe Braun, el film se convirtió rápidamente en un éxito de crítica y taquilla.

Fuguet es profesor de la Universidad Alberto Hurtado, y es considerado como una de las más importantes nuevas voces de la literatura chilena.