Nace en La Habana, Cuba, el 19 de noviembre de 1939. Forma parte de los jóvenes que integran la Sociedad Cultural “Cine Club Visión”, de cuyo seno salen cineastas que después se integran al Instituto Cubano de Arte e Industria Cinematográficos (ICAIC) en su fundación. En 1959, comienza a trabajar en el ICAIC, como asistente de dirección de documentales y largometrajes. Fue asistente de dirección de Tomás Gutiérrez Alea (Titón) en el cuento "La batalla de Santa Clara", del largometraje “Historias de la Revolución”. En 1961, dirige su primer documental: “Cinco picos”. Trabaja en el Noticiero ICAIC Latinoamericano, donde realiza 34 ediciones. En 1973, se inició como director de largometrajes con el filme “El hombre de Maisinicú”, con el destacado actor Sergio Corrieri en el papel protagónico, un filme que le valdría múltiples reconocimientos, y se convertiría en un éxito de público y crítica.
En 1977, ocupa el cargo de presidente de la Sección de Cine, Radio y Televisión de la Unión de Escritores y Artistas de Cuba (UNEAC), hasta 1978. Asesor artístico de la Productora Cinematográfica ICAIC; a partir de 1974, trabaja en la asesoría artística de documentales, e imparte seminarios y cursos de apreciación cinematográfica en instituciones culturales. Colabora, además, en la realización de críticas cinematográficas para la revista Cine Cubano.
Fue fundador del Comité de Cineastas de América Latina, constituido en Caracas en septiembre de 1974, y es Miembro Fundador y del Consejo Superior y Directivo de la Fundación del Nuevo Cine Latinoamericano (fnCl), desde su creación en 1985, con el Premio Nobel de Literatura colombiano Gabriel García Márquez, como su Presidente.
De 1988 a 1992, funge como director de uno de los Grupos de Creación del ICAIC, responsable de la realización de filmes como “La bella del Alhambra”, “Alicia en el pueblo de Maravillas”, “Adorables mentiras”, “Hello Hemingway” y “Madagascar”. Fue coguionista y codirector del documental de largometraje “Del otro lado del cristal”, sobre la Operación Peter Pan. En 2006, estrenó el largometraje de ficción “Páginas del diario de Mauricio”, que sería presentado y galardonado en diversos festivales internacionales.
Entre los premios y reconocimientos recibidos por su obra destacan los otorgados a “El hombre de Maisinicú”, Premio a la Mejor Actuación Masculina para Sergio Corrieri en el 8º Festival Internacional de Cine de Moscú, URSS, y que fue seleccionado entre los filmes más significativos exhibidos en 1973 por la Selección Anual de la Crítica en Cuba. Otro filme muy galardonado fue “Río Negro”, Premio especial del Jurado 10º Festival Internacional de Cine de Moscú, y seleccionado por la crítica cubana entre los mejores filmes del año 1977. También entre sus largometrajes de ficción más reconocidos está “Páginas del diario de Mauricio”, que se alzó con el Premio Especial del Jurado en el Festival Internacional de Huelva. España, en el 2006, y obtuvo una Mención Especial del Jurado del 28 Festival Internacional del Nuevo Cine Latinoamericano de La Habana ese mismo año, entre otros reconocimientos nacionales e internacionales.
En 2013, el Instituto Cubano del Arte e Industria Cinematográficos (ICAIC) hizo el anuncio del otorgamiento al destacado cineasta del Premio Nacional de Cine de ese año. Fue reconocido así con el máximo galardón que otorga la institución, de la cual fue fundador. En esa ocasión, Pérez confesó ser cineclubista de formación y cineasta de vocación, pues fue a través del cine que comenzó su vida político-social. Como fundador del ICAIC ha tenido el privilegio de vivir grandes momentos de la cultura nacional y especialmente el cine.
En 2019, en acto presidido por Miguel Díaz-Canel Bermúdez, Presidente de la República de Cuba, recibió el Premio Maestro de Juventudes, que otorgan los jóvenes artistas pertenecientes a la Asociación Hermanos Saíz (AHS) a relevantes figuras de la cultura cubana.
En 2021, la televisión cubana estrenó, con una gran acogida, su largometraje documental “La vida que ha quedado atrás”, un testimonio de más de 2 horas de duración del Teniente General de la KGB soviética, Nikolai Leonov, montado sobre imágenes de archivos poco conocidas, que revelan momentos trascendentales de la historia del siglo XX y especialmente de las relaciones entre Cuba y la URSS, y que constituye, según su realizador, un homenaje a la figura de su protagonista.
Filmografía como director
Cinco Picos (Doc) 1961.
Caimanera (Doc. 8´) 1962.
Pueblo de Estrellas Bajas (Doc. 9´) 1963.
Era Nikel Co. (Doc. 15´) 1963.
La Esperanza (Ficc. 25´) 1964.
Grandes y Chiquitos (Doc. 8´) 1966.
El Desertor (Ficc. 37´) 1968.
El hombre de Maisinicú (LM. Ficc. 124´) 1973.
Río Negro (LM. Ficc. 140´) 1977.
La segunda hora de Esteban Zayas (LM. Ficc. 90´) 1984.
Del otro lado del Cristal (Coguionista y Codirección. Doc. sobre la Operación Peter Pan. 52´) 1995.
Che Guevara: donde nunca jamás se lo imaginan, de la serie Doc. Cuba: Caminos de Revolución.
La Solidaridad Internacional, de la serie Documental, Cuba: Caminos de Revolución. 2004
Páginas del diario de Mauricio (LM ficc.) 2006.
La vida que ha quedado atrás (LM Documental]] 2021.